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《終極通牒》的主線承接《終極戰隊》第三部的故事。
《終極戰隊》第三部 原本該坐牢的蟻人漢克·皮姆，被判在鐵人的公館軟禁。他曾和其妻子黃蜂共同設計了歐超昂（Ultron）機器人，為同住在公館的終極戰隊成員服務。壹個歐超昂機器人偷偷將鐵人托尼·斯達克和叛徒黑寡婦過去的性愛錄像放到了網上，以分散註意力。用藥物迷倒了蟻人。並在街上，射殺了紅巫女。傷心欲絕的紅巫女的弟弟快銀回到了公館（這對姐弟關系極其曖昧）。而後萬磁王帶著人馬殺到，把他兒子快銀和她女兒的屍體帶回了野人島。醒來的漢克·皮姆和黃蜂發現了歐超昂機器人的真相。這個機器人竟然愛上了紅巫女，尾隨到他們姐弟兩人到了大街上。當他意識到這兩人的“愛侶關系”後，意識到自己沒希望的機器人，決定玉石俱焚。便開槍打死了紅巫女。他還利用終極戰隊成員的DNA，造出了壹批仿終極戰隊成員的機器人。（機器人零件都采用了非純金屬物質）。他自己則穿上壹件新戰服，自命為“黃衫俠”。
在野人島，三方打了起來。機器人全部被毀。萬磁王方大敗。當雙方平靜下來，黃蜂告訴萬磁王事情緣由時。鷹眼用機器人的壹個零件當箭射向了萬磁王。快銀則因飛身為父親檔箭而死。憤怒的萬磁王帶著自己兒子的屍體離去，並奪走了正向他叫囂的雷神托兒的錘子....
在兒子的屍體前，萬磁王立下詛咒“他們要為自己的所作所為...付出終極代價！”而眾人所並不知曉的是，歐超昂機器人並沒有愛上紅巫女，他根本沒有感情。壹切都是毀滅博士的精心策劃。
《終極蜘蛛俠》128期 屠夫和格溫·斯泰西共生體吞噬了埃迪。卻反而使得埃迪再次變回了毒液。毒液又將格溫身上的“殘留”全部吸走，變的更加強大。而後逃之夭夭。而格溫則完全變回了正常人。
